Otepää vald moodustati Otepää linna ja Pühajärve valla ühinemise tulemusena 22. oktoobril 1999.

Otepää ja Pühajärve vallad moodustati 1939. aastal väikeste valdade liitmise tulemusena. Vallad kuulusid kuni 1950. aastani Tartumaa koosseisu. 1950. aastal moodustati külanõukogud, mis aastatel 1950-59 kuulusid Otepää rajooni, 1959-62 aga Elva rajooni koosseisu. 1960. aastal liideti Pühajärve külanõukogu ja Otepää külanõukogu ning nimeks sai Otepää külanõukogu. Valga rajooni koosseisu arvati Otepää külanõukogu 1962. aastal. 31. oktoobril 1991 nimetati Otepää külanõukogu ümber Pühajärve külanõukoguks. Pühajärve vald loodi Pühajärve külanõukogu piires ning vald sai omavalitsusliku staatuse 5. märtsil 1992.

Otepää linn oli aastatel 1919-36 aleviõigustes. Linnaõigused sai Otepää 1. aprillil 1936. Otepää kuulus kuni 1950. aastani Tartumaa koosseisu. Aastatel 1950-59 oli linn Otepää rajooni keskuseks, 1959-62 aga kuulus Elva rajooni koosseisu. Valga rajooni koosseisu arvati Otepää linn 1962. aastal. Omavalitsusliku staatuse sai Otepää linn 21. veebruaril. 1991. Alates oktoobrist 1999 on Otepää linn Otepää valla koosseisu kuuluv vallasisene linn.